Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo4Q6PAQ4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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