Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp2d40Q6P8N9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms