Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms