Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac10Q6P3E7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac10Q6P3E7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms