Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms