Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mvb12bQ6KAU4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms