Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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