Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C1qtnf6Q6IR41 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf6Q6IR41 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms