Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms