Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spty2d1Q68FG3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spty2d1Q68FG3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms