Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ca4Q64444 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms