Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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