Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc18Q640L5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc18Q640L5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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