Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lcn3Q62471 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn3Q62471 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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