Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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