Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall3Q62255 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms