Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Six3Q62233 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six3Q62233 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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