Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema5aQ62217 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5aQ62217 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms