Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms