Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms