Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms