Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama3Q61789 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms