Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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AtrxQ61687 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrxQ61687 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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