Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ecm1Q61508 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ecm1Q61508 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms