Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vsx2Q61412 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms