Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln3Q61124 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms