Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JrkQ60976 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
JrkQ60976 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JrkQ60976 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms