Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik1Q60934 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms