Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk2a1Q60737 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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