Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms