Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms