Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms