Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms