Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf215Q5SPX3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf215Q5SPX3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms