Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms