Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms