Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3558Q5FWC9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3558Q5FWC9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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