Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms