Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bdp1Q571C7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms