Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lin28bQ45KJ6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lin28bQ45KJ6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28bQ45KJ6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28bQ45KJ6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28bQ45KJ6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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