Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms