Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm6Q3UZD5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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