Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms