Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms