Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms