Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp560Q3URI6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms