Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx21Q3UR97 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx21Q3UR97 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms