Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms