Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3UPC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms