Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms